建立生物DNA條形碼全球統(tǒng)一數(shù)據(jù)庫(kù)

訊石光通訊網(wǎng) 2009/8/7 8:40:50
     “野外露營(yíng)時(shí),被不知名的蟲子咬了一口,要想知道咬人的蟲子是否有毒,只需用隨身攜帶的DNA條形碼掃描儀輕輕刷一下小蟲子,儀器上隨即顯示它的名稱等信息。如果想進(jìn)一步了解,可以上網(wǎng)在全球通用的物種DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行檢索,了解這一物種的特性及應(yīng)對(duì)方法。”在日前參加中國(guó)科協(xié)第31期新觀點(diǎn)新學(xué)說(shuō)學(xué)術(shù)沙龍的專家們看來(lái),這不再是遙不可及的夢(mèng)想。

  目前,地球上已知的生物至少已有150萬(wàn)種,但一個(gè)人能夠認(rèn)識(shí)的物種不過(guò)1000多種。DNA條形碼技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,這種用DNA鑒定物種的技術(shù),是一種快速的、可自動(dòng)化的以及全球通用的分類鑒定工具。南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授卜文俊說(shuō),DNA條形碼的優(yōu)點(diǎn)在于在沒(méi)有形態(tài)分類專家的參與下,能提供快速的物種評(píng)估;在結(jié)合形態(tài)學(xué)的基礎(chǔ)上,還可進(jìn)行深入細(xì)致的形態(tài)分析,如形態(tài)功能、進(jìn)化適應(yīng)等。

  主持沙龍的中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物所研究員黃大衛(wèi)說(shuō),DNA條形碼為我們認(rèn)識(shí)生物提供了一個(gè)新的方式。

  中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所媒介生物控制室主任劉起勇,曾赴東南亞海嘯災(zāi)區(qū)承擔(dān)登革熱、瘧疾等疾病的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和技術(shù)支持。他認(rèn)為,DNA條形碼是一種極具潛力的傳染病監(jiān)控技術(shù)。在常規(guī)病媒生物監(jiān)測(cè)和疫源地調(diào)查和疫情處理過(guò)程中,需要在現(xiàn)場(chǎng)處理大量的標(biāo)本,如果對(duì)標(biāo)本的鑒定不能做到細(xì)致準(zhǔn)確,就不能將完整標(biāo)本帶回實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行細(xì)致鑒定。而在一些昆蟲的滋生地調(diào)查中,主要得到一些不同發(fā)育階段的幼蟲,也不利于種類的準(zhǔn)確鑒定。因此,DNA條形碼技術(shù)可以用于標(biāo)本或樣品的準(zhǔn)確鑒定分類。

  因此,全世界急需這樣一種快捷、精確、以DNA條形碼為基礎(chǔ)、全球通用的分類鑒定工具。但是,針對(duì)生物界150多萬(wàn)種物種,DNA條形碼識(shí)別系統(tǒng)的建立十分艱難。

  建立全球生物DNA條形碼公共數(shù)據(jù)庫(kù),并不像想象中的那么容易。卜文俊說(shuō),建立一個(gè)庫(kù)需要很多要素:地理分布、照片、生物學(xué)的記載、系統(tǒng)發(fā)育或者是種群學(xué)的數(shù)據(jù),還需要跟其他大的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行鏈接。“也許這個(gè)庫(kù)最終不是一個(gè)單一的庫(kù),而是生物多樣性記載的一個(gè)庫(kù)。分子的數(shù)據(jù)通過(guò)條形碼來(lái)體現(xiàn)。”

  “從條形碼本身來(lái)講,物品的條形碼是唯一的。但是對(duì)于生物來(lái)說(shuō),我們所用的條形碼不是人為編制的,而是形成的一個(gè)基因序列。在不同的物種間和物種內(nèi)有變異的范圍,唯一性不強(qiáng)。”卜文俊說(shuō)。

  “現(xiàn)在的做法是,變異范圍是一個(gè)經(jīng)驗(yàn)值,比如2%、3%的序列差異。”卜文俊介紹,分子體現(xiàn)的是同一物種下的多樣性,而如何記載同一物種中的大量的變異問(wèn)題——是換成不同的物種記載,還是記載物種下的變異類型,這成為DNA條形碼工作中的難點(diǎn)。

  對(duì)于這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的特性,卜文俊則呼吁,“它應(yīng)該是一個(gè)公共的數(shù)據(jù)庫(kù),全球參與”。在數(shù)據(jù)庫(kù)建好之后,也可以引入商業(yè)機(jī)制,進(jìn)行基于數(shù)據(jù)庫(kù)的其他分析。

  與會(huì)的其他專家表示,DNA條形碼技術(shù)與其他分類學(xué)方法結(jié)合使用,能夠幫助區(qū)別個(gè)體以及加快發(fā)現(xiàn)新種類的速度,條形碼作為一種初步篩選技術(shù),能夠達(dá)到快速識(shí)別的目的,但是要最終確定一個(gè)新物種,還需要其他很多縝密的檢測(cè)手段。

新聞來(lái)源:科學(xué)網(wǎng)a5

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